有關112年10月19日「反龍潭科學園區第三期擴建案自救會」前往科管局進行抗議，並要求竹科管理局回復擴建計畫疑義處，並撤回龍潭科學園區擴建計畫案1事，竹科管理局回應表示：
竹科以產業發展佈局，非為單一廠商徵地
園區設置的目的係為引進高級技術產業及科學技術人才，提升區域創新整合能量，以激勵國內產業技術之研究創新，並促進高級技術之產業發展。鑒於新竹及龍潭園區土地均已滿租，考量北臺灣高科技人才密集、產業聚落成熟及交通便利，且水電供應等配套均能因應，故選定龍潭園區東側區域進行擴建用地評估，日後完成用地取得後，依園區土地核配流程，辦理廠商配租作業，提供高科技產業建廠營運。
竹科管理局均依法行政，絕無違法進行土地徵收情事
竹科管理局於112年7月26日舉辦公聽會係依土地徵收條例規定，於事業計畫報核前舉行公聽會。會中已針對興辦事業概況、事業計畫之公益性、必要性、適法性及合法性進行說明並展示相關圖籍，以聽取民眾意見，俾公益考量與私益維護得以兼顧，並促進政府決策透明化。
積極聽取及整合民眾意見，重新評估本計畫用地範圍
竹科管理局因應地方有不同聲音，將重新評估本計畫用地需求，積極聽取及整合民眾意見，調整擴建範圍，並盡最大努力兼顧民眾權益，期望民眾能循正常管道表達意見，理性溝通，達到產業發展與民眾權益雙贏的局面。