支持進行快速的接近樣本冠狀病毒測序,從而對疫情爆發進行監測
英格蘭牛津2020年2月3日 /美通社/ -- 在獲得中國公共健康專業人員的廣泛支持並與他們進行合作之後,Oxford Nanopore已經向中國發運了另外200台MinION測序儀以及相關耗材。這些器械將被用於對現在的冠狀病毒爆發進行持續監測,為已經在中國安裝的設備帶來大批支援力量。
700Kg of Oxford Nanopore sequencers and consumables are on their way for use by Chinese scientists in understanding the current coronavirus outbreak.
MinION is the only portable, real-time device for DNA and RNA sequencing.
Each MinION sequencer is approximately the size of a stapler, and can provide rapid sequence information about the coronavirus.
Oxford Nanopore已經為100多個中國公共衛生實驗室,以及一系列中國微生物學實驗室和全球公共衛生科學家提供支持,越來越多的科學家開始參與監測過程。
Oxford Nanopore行政總裁Gordon Sanghera博士表示:「我們很榮幸能夠與全球科學界合作,支持他們了解此次疫情爆發的問題。我們希望納米孔能使任何人能夠在任何地方獲取生物信息,并能夠產生積極的影響,並且非常感謝科學界在我們努力為此次疫情爆發迅速優化時,給予我們支持。」
MinION測序儀被設計用來進行廣泛使用。這款測序儀重量不超過100克,搭配便攜式/特別配件MinIT,以便進行數據分析。MinION測序儀能夠實時簡化序列數據,支持進行快速測序,非常適合在分散開來的地點開展快速測序工作。之前,這款設備已經在鄉村/偏遠地區背景下,進行過測序,例如支持對伊波拉病毒、寨卡病毒或結核杆菌的了解。
伯明翰大學(University of Birmingham)的Josh Quick於2016年在《自然》(Nature)雜志上表示:「我們能夠在獲得埃博拉病毒陽性樣本24小時以內取得結果,測序過程僅需15分鐘至60分鐘。我們能夠證明,在資源有限的背景下,進行實時基因組監測是可行的,這樣的監測能夠迅速展開,支持監測疫情。」(請參閱:https://www.nature.com/articles/nature16996 )
冠狀病毒的快速排序,一直都是了解疫情爆發問題上面的一項必要工具。序列信息一般能夠將地點和時間數據結合到一起,就病毒如何傳播和是否發生變異,進行洞察分析。
Oxford Nanopore的測序技術,已經被用於來自於中國的眾多早期冠狀病毒基因組的測序,包括在《新英格蘭醫學期刊》(NEJM)上公佈的首個基因組,在《柳葉刀》(Lancet)雜志上發佈的表明人際間傳播的家族「聚集性」肺炎的基因組,以及美國發佈的首個新型冠狀病毒基因組。
科學界的研究者已經為新型冠狀病毒(nCoV)的納米孔測序,開發了專門方案;Oxford Nanopore正在與科學界一起對這些方案進行優化。
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